設校沿革
1989年4月台灣基督長老教會召開第36屆總會年議會，當時由新竹聖經學院和松年事工委員會共同提出成立「松年大學」之議案，獲得全體議員一致表決通過，任命「松年大學籌備委員會」盡速創辦「松年大學」。
當年7月14日台南中會松年部於太平境馬雅各紀念教會，舉行松年大學分校籌備會，議決分校名稱「台灣基督長老教會松年大學台南第一分校」，8月開始招生，9月10日舉行開學禮拜，9月12日第一年第一學期「秋季班」正式上課，來報名註冊學員數18名，成為第一間設立分校的松年大學。
本校當初係屬台南中會松年部主辦，校長由中會議長兼任，中會教育部長擔任教務副校長，中會松年部長擔任行政副校長，校務委員由中會派四位牧師、松年部派三位部員組成校務委員會。因中會本身無適當的教室，自開辦以來一直借用太平境馬雅各紀念教會為校址，並在教會「長春教室」上課，因此太平境馬雅各紀念教會的牧師就擔任本校校牧，也是校務委員。
1993年6月第一屆畢業生（學士班）畢業，畢業生只有3名，由於人數太少，這3名畢業生北上合併參加台北雙連分校畢業典禮，第二屆於1995年5月25日在本校自辦畢業典禮（學士班、碩士班），畢業生17名。當時松年大學設立學士班要讀四年，碩士班二年，鑑於許多畢業生反應，再增設博學班，博學班又分七級，每級三年，每完成一級則頒發證書以資鼓勵，但不授予「博士學位」，要全程完成松年大學課程共需27年，以使學員能終身修讀，享受「活到老，學到老」之樂趣。
2011年4月台南中會提議由太平境馬雅各紀念教會來接辦「松年大學」之校務，6月19日教會小會組織籌備委員會，通過延用原校名稱「松年大學台南第一分校」。7月7日台南中會第81屆秋季議會決議「松年大學台南第一分校」，正式由太平境馬雅各紀念教會承接辦理，校長由小會詮派，副校長由校長邀請擔任，各幹部於班會中由學員推舉選出，共同來推展校務。
台南第一分校20171006開學禮拜